Ya sea que esté formateando una unidad interna, una unidad externa, una unidad flash USB o una tarjeta SD, Windows le ofrece la opción de usar tres sistemas de archivos diferentes: NTFS, FAT32 y exFAT. El cuadro de diálogo Formato en Windows no explica la diferencia, así que lo haremos.
Un sistema de archivos proporciona una forma de organizar una unidad. Especifica cómo se almacenan los datos en la unidad y qué tipos de información se pueden adjuntar a los archivos: nombres de archivo, permisos y otros atributos. Windows admite tres sistemas de archivos diferentes. NTFS es el sistema de archivos más moderno. Windows usa NTFS para su unidad del sistema y, de forma predeterminada, para la mayoría de las unidades no extraíbles.
FAT32 es un sistema de archivos más antiguo que no es tan eficiente como NTFS y no admite un conjunto de características tan grande, pero ofrece una mayor compatibilidad con otros sistemas operativos. exFAT es un reemplazo moderno para FAT32, y más dispositivos y sistemas operativos lo admiten que NTFS, pero no está tan extendido como FAT32.
¿De qué vamos a hablar?
Sistema de archivos NT (NTFS)

NTFS es el sistema de archivos moderno que a Windows le gusta usar de forma predeterminada. Cuando instala Windows, formatea su unidad con el sistema de archivos NTFS. NTFS tiene límites de tamaño de archivos y particiones que son tan teóricamente enormes que no se encontrará con ellos. NTFS apareció por primera vez en las versiones de consumo de Windows con Windows XP, aunque originalmente debutó con Windows NT.
NTFS está repleto de características modernas que no están disponibles para FAT32 y exFAT. NTFS admite permisos de archivos para seguridad, un diario de cambios que puede ayudar a recuperar rápidamente errores si su computadora se bloquea, instantáneas para copias de seguridad, cifrado, límites de cuota de disco, enlaces duros y varias otras características. Muchos de estos son cruciales para una unidad del sistema operativo, especialmente los permisos de archivos.
La partición del sistema de Windows debe ser NTFS. Si tiene una unidad secundaria junto con Windows y planea instalar programas en ella, probablemente debería seguir adelante y hacerla NTFS también. Y, si tiene alguna unidad donde la compatibilidad no es realmente un problema, porque sabe que solo la usará en sistemas Windows, continúe y elija NTFS.
A pesar de sus ventajas, donde NTFS carece es de compatibilidad. Funcionará con todas las versiones recientes de Windows, desde Windows XP, pero tiene una compatibilidad limitada con otros sistemas operativos. De forma predeterminada, las Mac solo pueden leer unidades NTFS, no escribir en ellas. Algunas distribuciones de Linux pueden habilitar el soporte de escritura NTFS, pero algunas pueden ser de solo lectura. Ninguna de las consolas PlayStation de Sony es compatible con NTFS. Incluso la propia Xbox 360 de Microsoft no puede leer unidades NTFS, aunque las nuevas Xbox Series X, S y One sí. Es aún menos probable que otros dispositivos admitan NTFS.
Compatibilidad: Funciona con todas las versiones de Windows, pero solo de lectura con Mac de forma predeterminada, y puede ser de solo lectura de forma predeterminada con algunas distribuciones de Linux. Otros dispositivos, con la excepción de Xbox One de Microsoft, probablemente no admitirán NTFS.
Límites: No hay límites realistas de tamaño de archivo o tamaño de partición.
Uso ideal: Úselo para su unidad de sistema de Windows y otras unidades internas que solo se usarán con Windows.
Tabla de asignación de archivos 32 (FAT32)

FAT32 es el más antiguo de los tres sistemas de archivos disponibles para Windows. Se introdujo en Windows 95 para reemplazar el antiguo sistema de archivos FAT16 utilizado en MS-DOS y Windows 3.
La antigüedad del sistema de archivos FAT32 tiene ventajas y desventajas. La gran ventaja es que debido a que es tan antiguo, FAT32 es el estándar de facto. Las unidades flash que compre a menudo vendrán formateadas con FAT32 para una máxima compatibilidad no solo en computadoras modernas, sino también en otros dispositivos como consolas de juegos y cualquier cosa con un puerto USB.
Sin embargo, las limitaciones vienen con esa edad. Los archivos individuales en una unidad FAT32 no pueden tener más de 4 GB de tamaño, ese es el máximo. Una partición FAT32 también debe tener menos de 8 TB, lo que ciertamente es una limitación menor a menos que esté utilizando unidades de súper alta capacidad.
Si bien FAT32 está bien para unidades flash USB y otros medios externos, especialmente si sabe que los usará en cualquier cosa que no sean PC con Windows, no querrá FAT32 para una unidad interna. Carece de los permisos y otras características de seguridad integradas en el sistema de archivos NTFS más moderno. Además, las versiones modernas de Windows ya no se pueden instalar en una unidad formateada con FAT32; deben instalarse en unidades formateadas con NTFS.
Compatibilidad: Funciona con todas las versiones de Windows, Mac, Linux, consolas de juegos y prácticamente cualquier cosa con un USB pOrt.
Límites: tamaño máximo de archivo de 4 GB, tamaño máximo de partición de 8 TB.
Uso ideal: Úselo en unidades extraíbles donde necesite la máxima compatibilidad con la más amplia gama de dispositivos, suponiendo que no tenga ningún archivo de 4 GB o más de tamaño.
Tabla de asignación de archivos extendida (exFAT)

El sistema de archivos exFAT se introdujo en 2006 y se agregó a versiones anteriores de Windows con actualizaciones de Windows XP y Windows Vista. exFAT está optimizado para unidades flash, diseñado para ser un sistema de archivos ligero como FAT32, pero sin las características adicionales y la sobrecarga de NTFS y sin las limitaciones de FAT32.
Al igual que NTFS, exFAT tiene límites muy grandes en los tamaños de archivo y partición, lo que le permite almacenar archivos mucho más grandes que los 4 GB permitidos por FAT32.
Si bien exFAT no coincide con la compatibilidad de FAT32, es más compatible que NTFS. Mientras que macOS incluye soporte de solo lectura para NTFS, los Mac ofrecen soporte completo de lectura y escritura para exFAT. Se puede acceder a las unidades exFAT en Linux instalando el software adecuado. Los dispositivos pueden ser un poco mixtos. PlayStation5 y PlayStation 4 son compatibles con exFAT; la PlayStation 3 no lo hace. Xbox Series X, S y One lo admiten, pero Xbox 360 no.
Compatibilidad: Funciona con todas las versiones de Windows y versiones modernas de macOS, pero requiere software adicional en Linux. Es posible que más dispositivos admitan exFAT que NTFS, pero algunos, especialmente los más antiguos, solo admitan FAT32.
Límites: No hay límites realistas de tamaño de archivo o tamaño de partición.
Uso ideal: Úselo cuando necesite un tamaño de archivo y límites de partición más grandes que los que ofrece FAT32 y cuando necesite más compatibilidad que las ofertas de NTFS. Suponiendo que todos los dispositivos con los que desea usar la unidad son compatibles con exFAT, debe formatear su dispositivo con exFAT en lugar de FAT32.
NTFS es ideal para unidades internas, mientras que exFAT es generalmente ideal para unidades flash. Sin embargo, es posible que a veces deba formatear una unidad externa con FAT32 si exFAT no es compatible con un dispositivo con el que necesita usarla.